Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf4Q8VI88 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf4Q8VI88 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms