Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fam20bQ8VCS3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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