Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q8VCE4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q8VCE4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q8VCE4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q8VCE4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q8VCE4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VCE4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VCE4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VCE4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VCE4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms