Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Med17Q8VCD5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med17Q8VCD5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms