Protein–RNA interactions for Protein: Q8R5M0

Gipc3, PDZ domain-containing protein GIPC3, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc3Q8R5M0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc3Q8R5M0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms