Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nup35Q8R4R6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup35Q8R4R6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup35Q8R4R6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nup35Q8R4R6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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