Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaaf4Q8R368 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaaf4Q8R368 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaaf4Q8R368 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaaf4Q8R368 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaaf4Q8R368 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf4Q8R368 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf4Q8R368 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf4Q8R368 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf4Q8R368 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf4Q8R368 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf4Q8R368 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf4Q8R368 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf4Q8R368 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf4Q8R368 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf4Q8R368 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf4Q8R368 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf4Q8R368 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf4Q8R368 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf4Q8R368 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf4Q8R368 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf4Q8R368 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf4Q8R368 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dnaaf4Q8R368 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dnaaf4Q8R368 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dnaaf4Q8R368 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnaaf4Q8R368 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms