Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Vmn1r200Q8R281 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r200Q8R281 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Vmn1r200Q8R281 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Vmn1r200Q8R281 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Vmn1r200Q8R281 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Vmn1r200Q8R281 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Vmn1r200Q8R281 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
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Vmn1r200Q8R281 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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