Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rdh16f2Q8K3M1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rdh16f2Q8K3M1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms