Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccm2Q8K2Y9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms