Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1eQ8K202 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1eQ8K202 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms