Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms