Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Upp2Q8CGR7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms