Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf17Q8CFA7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf17Q8CFA7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms