Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RybpQ8CCI5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RybpQ8CCI5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms