Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rnf170Q8CBG9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf170Q8CBG9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf170Q8CBG9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf170Q8CBG9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf170Q8CBG9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf170Q8CBG9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf170Q8CBG9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf170Q8CBG9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf170Q8CBG9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf170Q8CBG9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf170Q8CBG9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf170Q8CBG9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf170Q8CBG9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf170Q8CBG9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rnf170Q8CBG9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf170Q8CBG9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf170Q8CBG9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf170Q8CBG9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf170Q8CBG9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf170Q8CBG9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf170Q8CBG9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf170Q8CBG9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf170Q8CBG9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf170Q8CBG9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf170Q8CBG9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf170Q8CBG9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf170Q8CBG9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rnf170Q8CBG9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rnf170Q8CBG9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf170Q8CBG9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rnf170Q8CBG9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rnf170Q8CBG9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf170Q8CBG9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf170Q8CBG9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf170Q8CBG9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf170Q8CBG9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf170Q8CBG9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rnf170Q8CBG9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf170Q8CBG9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf170Q8CBG9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rnf170Q8CBG9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf170Q8CBG9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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