Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrn3Q8CBC6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms