Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7cQ8C6E1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7cQ8C6E1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7cQ8C6E1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7cQ8C6E1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7cQ8C6E1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7cQ8C6E1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7cQ8C6E1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7cQ8C6E1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7cQ8C6E1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7cQ8C6E1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7cQ8C6E1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7cQ8C6E1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7cQ8C6E1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7cQ8C6E1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7cQ8C6E1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7cQ8C6E1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7cQ8C6E1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7cQ8C6E1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7cQ8C6E1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Apol7cQ8C6E1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apol7cQ8C6E1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apol7cQ8C6E1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apol7cQ8C6E1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apol7cQ8C6E1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apol7cQ8C6E1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms