Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp47Q8BY87 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp47Q8BY87 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp47Q8BY87 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms