Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ3

Lrtm1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm1Q8BXQ3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrtm1Q8BXQ3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm1Q8BXQ3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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