Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTE0

Sdhaf4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdhaf4Q8BTE0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdhaf4Q8BTE0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdhaf4Q8BTE0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms