Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLF2

Cdkl3, Cyclin-dependent kinase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl3Q8BLF2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkl3Q8BLF2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl3Q8BLF2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl3Q8BLF2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl3Q8BLF2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl3Q8BLF2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl3Q8BLF2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl3Q8BLF2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl3Q8BLF2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl3Q8BLF2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl3Q8BLF2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl3Q8BLF2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl3Q8BLF2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl3Q8BLF2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl3Q8BLF2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl3Q8BLF2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl3Q8BLF2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl3Q8BLF2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkl3Q8BLF2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl3Q8BLF2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms