Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem87bQ8BKU8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem87bQ8BKU8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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