Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHL8

Psmf1, Proteasome inhibitor PI31 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmf1Q8BHL8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmf1Q8BHL8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms