Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabra5Q8BHJ7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms