Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sv2bQ8BG39 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sv2bQ8BG39 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms