Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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H2-M10.4Q85ZW8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M10.4Q85ZW8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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