Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc50Q810U5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms