Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep170bQ80U49 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms