Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ClmQ7TSN2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms