Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms