Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Vma21Q78T54 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vma21Q78T54 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Vma21Q78T54 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Vma21Q78T54 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Vma21Q78T54 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Vma21Q78T54 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vma21Q78T54 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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