Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sys1Q78S06 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sys1Q78S06 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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