Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smim12Q78RX3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms