Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chsy1Q6ZQ11 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms