Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc88cQ6VGS5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms