Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casc1Q6TDU8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casc1Q6TDU8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Casc1Q6TDU8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casc1Q6TDU8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casc1Q6TDU8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casc1Q6TDU8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms