Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nudcd1Q6PIP5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nudcd1Q6PIP5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms