Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHU5

Sort1, Sortilin, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sort1Q6PHU5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sort1Q6PHU5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sort1Q6PHU5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms