Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmeff1Q6PFE7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmeff1Q6PFE7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmeff1Q6PFE7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmeff1Q6PFE7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmeff1Q6PFE7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmeff1Q6PFE7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmeff1Q6PFE7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmeff1Q6PFE7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmeff1Q6PFE7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmeff1Q6PFE7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmeff1Q6PFE7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmeff1Q6PFE7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmeff1Q6PFE7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmeff1Q6PFE7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmeff1Q6PFE7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmeff1Q6PFE7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmeff1Q6PFE7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmeff1Q6PFE7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmeff1Q6PFE7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmeff1Q6PFE7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmeff1Q6PFE7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmeff1Q6PFE7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmeff1Q6PFE7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmeff1Q6PFE7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmeff1Q6PFE7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmeff1Q6PFE7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms