Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chd4Q6PDQ2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chd4Q6PDQ2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms