Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atl2Q6PA06 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms