Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE28

Gm5416, Predicted gene 5416, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5416Q6IE28 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5416Q6IE28 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gm5416Q6IE28 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gm5416Q6IE28 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gm5416Q6IE28 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gm5416Q6IE28 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gm5416Q6IE28 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gm5416Q6IE28 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gm5416Q6IE28 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gm5416Q6IE28 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gm5416Q6IE28 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gm5416Q6IE28 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Gm5416Q6IE28 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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