Protein–RNA interactions for Protein: Q6A051

Atrnl1, Attractin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atrnl1Q6A051 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atrnl1Q6A051 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atrnl1Q6A051 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms