Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdzrn3Q69ZS0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms