Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cntn4Q69Z26 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms