Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim24Q64127 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim24Q64127 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim24Q64127 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim24Q64127 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim24Q64127 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim24Q64127 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim24Q64127 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim24Q64127 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim24Q64127 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim24Q64127 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim24Q64127 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim24Q64127 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim24Q64127 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim24Q64127 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim24Q64127 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim24Q64127 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim24Q64127 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms