Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc18Q640L5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc18Q640L5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc18Q640L5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
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