Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou4f3Q63955 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms