Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga3Q62470 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga3Q62470 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms